1. 问题概述

在使用VTK读取DICOM图像时有一个常见问题：通过vtkDICOMReader类读取的图像，与DICOM文件中记录的"ImagePositionPatient"值不一致，导致图像在三维空间中的定位出现偏差。

这一问题在与MITK等医学图像处理框架进行数据交互时尤为明显，MITK是直接读取"ImagePositionPatient"值自动变换的，如果有同时使用VTK和MITK读取、处理、对齐图像的场景，那这个偏差就很致命。

2. 解决问题

该问题的本质原因是VTK默认对DICOM图像进行了行序(ROW Order)的自动调整：

1. DICOM标准存储：采用从上到下(Top-Down)的存储方式
2. 显示系统惯例：使用从下到上(Bottom-Up)的显示方式
3. VTK默认行为：vtkDICOMReader默认启用BottomUp模式，会自动翻转图像行序

那么只要调用SetMemoryRowOrderToFileNative()方法强制与文件中对齐即可。

3. SetMemoryRowOrder()详细介绍

VTK在vtkDICOMReader类中提供了SetMemoryRowOrder()方法来控制这一行为。

1. 使用介绍

   VTK提供了三种行序模式，分别为FileNative、TopDown、BottomUp。

   且提供了多种设置方式，可参照源码如下：

    //! Enumeration for top-down vs. bottom-up ordering.
    enum RowOrder { FileNative, TopDown, BottomUp };
   
    //@{
    //! Set the ordering of the image rows in memory.
    /*!
     *  If the order is BottomUp (which is the default) then
     *  the images will be flipped when they are read from disk.
     *  The native orientation of DICOM images is top-to-bottom.
     */
    void SetMemoryRowOrder(int order);
    void SetMemoryRowOrderToFileNative() {
      this->SetMemoryRowOrder(FileNative); }
    void SetMemoryRowOrderToTopDown() {
      this->SetMemoryRowOrder(TopDown); }
    void SetMemoryRowOrderToBottomUp() {
      this->SetMemoryRowOrder(BottomUp); }
    int GetMemoryRowOrder() { return this->MemoryRowOrder; }
    const char *GetMemoryRowOrderAsString();

2. 三种行序模式对比

   方法	行序模式	行为特点	适用场景
   SetMemoryRowOrderToFileNative()	文件原生	保持DICOM原始行序	需要精确几何信息时
   SetMemoryRowOrderToTopDown()	从上到下	强制Top-Down存储	特殊需求场景
   SetMemoryRowOrderToBottomUp()	从下到上	VTK默认模式	直接显示场景

3. 使用示例

   vtkNew reader;
   reader->SetDirectoryName(dicomDir);
   // 关键设置：保持DICOM原始行序
   reader->SetMemoryRowOrderToFileNative(); // reader->SetMemoryRowOrder(0);
   reader->Update();
   vtkImageData* image = reader->GetOutput();